后来带领刘显、戚继光、俞大猷等名将，屡败倭寇。先后提督两广军务、巡抚陕西、总督蓟辽，任兵部尚书。
谭纶是继胡宗宪之后朝廷最为知兵的文臣，可谓矫矫虎臣、腹心干城。万历五年张翰因阻挠变法而去职，谭纶被朱翊钧任命为吏部尚书，加太子少保衔。
然而就任不到半年，竟然染疾去世，朱翊钧为之扼腕。和吕调阳等人商量过后，追赠其太子太保，定谥号“襄敏”。谭纶的去世，如断张居正一臂，在江陵的张居正听到谭子理去世的消息，为之痛惜。
万历五年十月初，接替谭纶为吏部尚书的李幼兹和度支部新任尚书郭朝宾上奏，请皇帝夺情张居正，待其三月假满，即回京师理事。
经过皇帝先后两年出考题点明“真孝”，报纸一年多的宣传，朝廷上下都明白皇帝改“丁忧”制度的决心早定，加上此时朝野政治高压，夺情之议并未像原时空那般引起较大波澜。
说实话，对于皇帝改“丁忧”制度，朝廷上下官员心内都有些若有若无的窃喜，谁愿意因为父母之丧耽误三年？官场生涯又有几个三年？
万历五年十月戊子，彗星见于西南，光明大如盏，苍白色长数丈，繇尾箕越斗牛。原时空引起轩然大波的“星变”如期来到，这次星变和张居正的“夺情”搅在一起，引起了万历朝第一次大规模党争，也为大明的灭亡埋下了伏笔之一。
后世被命名为c/1577v1的彗星，在经过数以百万年的旅程后，终于到达地球人可以观测的位置。此际的欧洲，丹麦科学家第谷布拉赫发现彗星是一种天体，且处于大气层之外。这一发现，为伽利略伽利雷“日心说”的发现又提供了一小块的素材，激发了那颗年轻而天才的大脑，促使他将更多的目光投向天文学。
而在本时空此际的大明朝，望远镜的发明和普及才刚刚开始。因为政治的高压和白色恐怖的氛围，言官、御史此时近乎失声，关于“星变”稀稀拉拉的奏本，不过是虚应故事，向皇帝表示此时大明朝的纠错机制没有宕机，还在发挥作用。
至于这作用大小，言官们表示，这要看皇帝您的心情，您想大就大，想小就小。
这些奏本中，无人请皇帝修省，也无利用玄象示异，反倒是有口一词，要求皇帝下旨，“儆愓大小臣工其恪修职业，以图消弭。”大家纷纷表示，皇帝没错，错的是我们，我们还没有领会皇帝要大兴变法的精神实质，在工作中拖拖拉拉，才导致老天爷不高兴，派彗星来的。
在深宫中养腿的朱翊钧，曾指示侍从室从头梳理历史上所有彗星的记录，试图从逻辑上证明“彗星灾异说”的谬误，从而动摇“天命不可违”思想，为变法扫除思想上的障碍。然而很遗憾的是，这次“谬误证明”最终走向了他愿望的反面，侍从们以史料上大量无可辩驳的事实证明，彗星这玩意的出现，大部分确实和灾异相关。
站在皇帝一方的侍从试图反证：灾异是一种常态，彗星是一种变量，两者重合并不意味着灾异和彗星有相关性，毕竟历史上好多次更大的灾异和亡国之兆并没有彗星作为呼应。
这不失为一条好的宣传路子，但驳倒这一论点也非常容易：谁规定“天”只用彗星这一种方式来示警的？地震、大水、异形的动植物，都是警告手段！
究其本质，董仲舒提出的“天人感应说”不过是对皇权无可奈何之下的约束手段。因为它从逻辑上的自洽，要推翻这一学说非得科学大成，且深入人心不可。
朱翊钧想利用历朝历代被天