0日里奥·费迪南德帮助曼联在英格兰社区盾杯决赛中战胜朴茨茅斯夺得冠军。10月27日里奥·费迪南德入选了2008年度国际职业球员协会最佳阵容。
12月21日里奥·费迪南德帮助曼联在国际足联俱乐部世界杯决赛中一比零战胜基多体育大学夺得冠军，12月26日里奥·费迪南德在英超第十九轮曼联对阵斯托克城的赛前热身中背伤复发，之后缺席了近一个月的比赛。2009年1月27日在曼联五比零大胜西布罗姆维奇的英超第二十三轮联赛中，里奥·费迪南德伤愈复出。 3月1日里奥·费迪南德帮助曼联在英格兰联赛杯决赛中通过点球大战击败托特纳姆热刺夺得冠军。5月27日曼联在欧冠决赛中对阵巴塞罗那，里奥·费迪南德首发出场，但未能帮助曼联夺得冠军。2008-09赛季里奥·费迪南德代表曼联在各项赛事中出场四十三次，帮助曼联连续第三年夺得英超联赛冠军。
2009年8月里奥·费迪南德因大腿肌肉撕裂缺席了赛季的前四场联赛。2009年10月至2010年1月里奥·费迪南德因背部和小腿的伤势缺席了两个半月的比赛。 2010年1月23日在曼联四比零战胜赫尔城的英超第二十三轮联赛中，里奥·费迪南德伤愈复出，但由于在比赛中肘击赫尔城球员克雷格·费根而遭到英足总的指控。1月28日里奥·费迪南德因肘击事件被英足总处以禁赛四场的处罚， 2009-10赛季里奥·费迪南德代表曼联在各项赛事中出场二十一次。
2010年6月里奥·费迪南德在英格兰队备战世界杯的训练课中膝盖受伤，之后错过了赛季的前六场比赛。里奥·费迪南德在曼联零比零战平桑德兰的英超第七轮联赛中伤愈复出。2011年2月至4月里奥·费迪南德因腿部的伤势缺席了两个半月的赛事。5月14日里奥·费迪南德帮助曼联在英超第三十七轮联赛中一比一战平布莱克本，从而提前一轮夺得了俱乐部历史上第十九座英格兰顶级联赛冠军。5月28日曼联在欧冠决赛中对阵巴塞罗那，里奥·费迪南德首发出场，但未能帮助曼联夺得冠军，2010-11赛季里奥·费迪南德代表曼联在各项赛事中出场二十九次。